A cargo de la Secretaría General se encuentran las áreas de: Mesa General de Entrada y Salida; Archivo General; Dirección General de Despacho, con las siguientes Funciones:

Asesorar en los aspectos técnicos a las autoridades de la Universidad
Asesoramiento permanente en aspectos institucionales y de relacionamiento al Sr. Rector en temas vinculados a la gestión.
Generación de acciones de vinculación con organismos gubernamentales, del sector privados y de la sociedad civil a efectos de la generación de convenios y acciones mancomunadas.
Participación en actividades de vinculación con otras Universidades Nacionales con el propósito de recabar información y tomar contactos con experiencias de gestión y de gobierno para la modificación e innovación de reglamentos y normas de nuestra Universidad.
Convocatoria para la exposición de experiencias de las Universidades Nacionales (Universidad Nacional de Tucumán, Univ. Nacional De Chilecito, Universidad Nacional de Salta) sobre modificaciones estatutarias para la implementación de Elección Directa de Autoridades.
Participación en la implementación del mecanismo de Elecciones Directas para la designación de autoridades de la Escuela de Minas.
Atención y comunicación permanente con Decanos de facultad a efectos de tratar y viabilizar temas prioritarios de gestión de las unidades académicas.
Coordinar y agilizar trámites de las Unidades Académicas en las distintas secretarias de Rectorado a efectos de dar celeridad a temas prioritarios.
Impartir instructivos de organización de la Mesa General de Entradas y Archivo de Rectorado.
Ordenamiento y sistematización de trámites de la Mesa General de Entradas.
Relevamiento de trámites y expedientes en cartera de la Mesa General de Entradas.
Intervenir en las notificaciones de los actos administrativos dictados por el Sr. Rector y por el Consejo Superior, indicando en cada caso los mecanismos de notificación pertinentes.
Participación permanente en el proceso de notificaciones de las convocatorias para las sesiones de consejo superior así como la de los distintos actos administrativos dictados por Rector y Consejo Superior.
Propender al mejoramiento de la técnica y ordenamiento normativo, con la elevación de los proyectos dirigidos a tal fin.
Facilitar el acceso a información así como a normativa para la confección y elevación de todos los proyectos elevados a rectorado y Consejo Superior.
Coordinar las actividades de las Secretarías de la Universidad, sus funciones y objetivos de las mismas.
Realización periódica de reuniones de Secretarias a efectos de realizar informes permanentes al Sr. Rector.
Elaborar permanentemente agenta conjunta de trabajo entre las distintas Secretarias de Rectorado.
Atender las relaciones públicas, institucionales y el ceremonial.
Recepción de Autoridades, Representantes y Referentes de las distintas instituciones que requieren vinculación con la UNJu.
Confección y Coordinación de Agenda Rector.
Participación y Monitoreo de los eventos y actos organizados por Rectorado.
Coordinación del Ceremonial en los actos con presencia del Sr. Rector.
Entender en todo lo relativo a la tramitación, identificación, manejo y archivo de la documentación que ingresa a la Universidad.
Organizaciones y relevamiento de expedientes del archivo.